Một số loại phân bón vi sinh được sử dụng phố biến hiện nay:
- Phân vi sinh cố định đạm (N)
- Phân vi sinh phân giải lân.
- Phân bón vi sinh phân giải silicat.
- Phân bón vi sinh ức chế các vi sinh vật gây bệnh.
- Phân bón vi sinh chứa chất giữ ẩm polysacarit.
- Phân vi sinh giúp phân giải hợp chất hữu cơ (cellulose)