- An toàn với sức khỏe con người: khác với các loại thuốc trừ sâu hóa học, thuốc trừ sâu sinh học được đánh giá là ít độc với con người.
- Thân thiện với môi trường: Các chế phẩm vi sinh vật, dầu thực vật dùng để trừ sâu hầu như không gây hại cho các sinh vật có ích (ví dụ như các loài thiên địch) nên nó có thể bảo vệ được sự cân bằng sinh học trong tự nhiên, hạn chế tình trạng bùng phát sâu hại.
- Thuốc sinh học ít để lại dư lượng độc trên nông sản và thời gian cách ly ngắn.